More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1224 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  51.84 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  50.71 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  50.34 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  51.85 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  52.88 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  49.82 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  46.96 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  45.76 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  45.58 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  42.43 
 
 		 415 aa  238  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  47.87 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  45.42 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  41.11 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  43.42 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  51.06 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  42.11 
 
 		 421 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  38.81 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  46.21 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.06 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  37.4 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  34.89 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.07 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  36.73 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.27 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37.4 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  37.36 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  37.36 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.6 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  36.39 
 
 		 471 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  35.62 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  35.62 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  36.6 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.73 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.55 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.6 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.73 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.73 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.25 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.05 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 278 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 278 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.88 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  32.63 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.18 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  32.92 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.17 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.09 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  36.8 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31.45 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  27.9 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  30.07 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.82 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  32.75 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  30.69 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.32 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.86 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.64 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  33.06 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.78 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  32.77 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  31.85 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  32.36 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  28.98 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  27.96 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  32.7 
 
 		 276 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  32.61 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  29.43 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  29.32 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  31.28 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.8 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.04 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.8 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.8 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.8 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.59 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.97 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>