More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0012 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
107 aa  216  8e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 
117 aa  133  7e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  64 
 
 
124 aa  132  1e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  61.17 
 
 
126 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  63.27 
 
 
124 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 
108 aa  129  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  70.65 
 
 
108 aa  126  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  60.61 
 
 
155 aa  124  4e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  58.16 
 
 
174 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  57.14 
 
 
138 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  57.14 
 
 
138 aa  119  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  57.14 
 
 
152 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  58.16 
 
 
153 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  56.44 
 
 
172 aa  117  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  62.64 
 
 
106 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  59.55 
 
 
176 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  47.5 
 
 
124 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  46.67 
 
 
124 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 
95 aa  82  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.6004e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  43.82 
 
 
95 aa  81.6  3e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
125 aa  76.3  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
95 aa  76.3  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.45168e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
125 aa  76.3  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.11758e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.42081e-06  hitchhiker  6.88979e-07 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 
124 aa  75.9  2e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.06973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.55569e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  7.42686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  75.5  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  42.42 
 
 
129 aa  75.5  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.04725e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.9  2e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.78233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.5  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  75.5  3e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  40.38 
 
 
144 aa  74.7  4e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 
147 aa  74.7  4e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  38.38 
 
 
134 aa  74.7  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 
125 aa  73.9  7e-13  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  35 
 
 
155 aa  73.6  8e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  38.3 
 
 
144 aa  73.9  8e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  73.6  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.05863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  38.38 
 
 
134 aa  72.8  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
95 aa  73.2  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  39.33 
 
 
93 aa  72.8  1e-12  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  72.8  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  35 
 
 
134 aa  71.6  3e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.71 
 
 
147 aa  70.9  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  34 
 
 
134 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
136 aa  70.5  8e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 
117 aa  70.1  9e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
135 aa  69.3  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
132 aa  69.3  2e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
128 aa  68.9  2e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 
112 aa  69.3  2e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
135 aa  69.3  2e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  9.7337e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 
168 aa  69.3  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 
126 aa  68.2  3e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
98 aa  68.6  3e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.43622e-08  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
142 aa  68.6  3e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  37.11 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 
145 aa  68.2  4e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
132 aa  67.8  4e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36.26 
 
 
104 aa  67.8  4e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
139 aa  68.2  4e-11  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  37.36 
 
 
96 aa  67.8  5e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.56289e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  38.38 
 
 
122 aa  67.4  6e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  67.4  6e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  35 
 
 
117 aa  67.4  7e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  34.07 
 
 
95 aa  67  7e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  4.3387e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 
128 aa  67  8e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
117 aa  67  8e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 
131 aa  67  8e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  39.33 
 
 
119 aa  67  9e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
117 aa  66.6  1e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.16 
 
 
94 aa  66.6  1e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32 
 
 
151 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32 
 
 
151 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 
137 aa  65.9  2e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
94 aa  65.9  2e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.93762e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  32 
 
 
151 aa  65.9  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  32.97 
 
 
94 aa  65.5  3e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  5.48177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 
151 aa  65.1  3e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  37.08 
 
 
210 aa  65.1  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  33 
 
 
152 aa  65.1  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
132 aa  64.7  4e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  33 
 
 
154 aa  64.3  5e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  42.86 
 
 
94 aa  64.7  5e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 
127 aa  63.9  6e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 
117 aa  64.3  6e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 
113 aa  63.9  6e-10  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 
120 aa  64.3  6e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
97 aa  63.9  7e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.26793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  35 
 
 
160 aa  63.9  7e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  34.07 
 
 
94 aa  63.9  7e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.56198e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>