More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1321 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  78.33 
 
 		 265 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  69.08 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  49.04 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  45.14 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  45.53 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  38.55 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  36.26 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  45.31 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  37.02 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  36.26 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  44.11 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  43.56 
 
 		 284 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  44.32 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  44.4 
 
 		 289 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  43.24 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  40.15 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  40.78 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  38.46 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  41.7 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  41.11 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.86 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.86 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  37.45 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  37.45 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  42.63 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.05 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.05 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.05 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.05 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.05 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  37.8 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.47 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  36.65 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  36.47 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  36.65 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.75 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.53 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.13 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  38.07 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  37.25 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  38.34 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  37.04 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.3 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  38.82 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.82 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  34.8 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.43 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  39.13 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  37.21 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.41 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.88 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  36.23 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  41.73 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  35.71 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  39.77 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  33.2 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.49 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  37.38 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  39.39 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  43.38 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  39.77 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  39.92 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  42.79 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  39.92 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  39.92 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  37.55 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  41.4 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.98 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  36.28 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  36.07 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  37.45 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  38.93 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  38.2 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  34.12 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  39 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  42.79 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.96 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  36.03 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  39.68 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  37.34 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  35.37 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  38.32 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  36.11 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  38.08 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  35.02 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  38.4 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  36.19 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.19 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  36.33 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  33.58 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  40 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  38.32 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  38.6 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  37.22 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  35.18 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  37.02 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  37.22 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  37.01 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  37.3 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>