More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06431 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  85.23 
 
 		 264 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  81.44 
 
 		 264 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  69.7 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  45.59 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  44.4 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  36.26 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  39.92 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  36.64 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  36.36 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  29.59 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  28.24 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  33.33 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  32.55 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  34.4 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  30.48 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  30.95 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  34.33 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  29.01 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  31.91 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  30.56 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  30.05 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  30.86 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  30.14 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  33 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  31.6 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  33.86 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  31.08 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  31.08 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  29.27 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  29.17 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  33.33 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  31.32 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  27.27 
 
 		 284 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  32.86 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  30.35 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  31.84 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  30.05 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  33.06 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  28 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  30.54 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  29.27 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  31.15 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  27.5 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  28.4 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  30.56 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  28.4 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  33.33 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  28.4 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  30.73 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  27.27 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  32.02 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  28.4 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  27.63 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  33.66 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  28.57 
 
 		 270 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  33.83 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  32.35 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  30.5 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  28.57 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  28.11 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.6 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  30.24 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  30.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  25.28 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  25.38 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  27.66 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  26.84 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  28.06 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  31.02 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  31.84 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  25.38 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  29.81 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  29.76 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  35.5 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  29.7 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  31.02 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  26.19 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  28.97 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  27.01 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  29.86 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  31.46 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  29.06 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  27 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  32.18 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  28.35 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  28.5 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  30.05 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  29.3 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  30.71 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0492  glutamate racemase  33.5 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  25.57 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>