More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10321 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  51.13 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  49.04 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  46.18 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  45.42 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  49.43 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  41.51 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  39.92 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  38.61 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  37.26 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.16 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  38.46 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  38.02 
 
 		 284 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  40 
 
 		 295 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  37.45 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  37.93 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  37.55 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  36.05 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.97 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  35.22 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.39 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  37.8 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  37.8 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36 
 
 		 278 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  36 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  35.6 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  32.94 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  40.8 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.32 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  35.14 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  34.7 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  36.98 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  37.8 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  35.86 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  36.36 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  35.94 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  35.94 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  34.4 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  34.47 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  36.74 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  31.4 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  34.13 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  34 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  34.12 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  33.21 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.1 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  34.11 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  34.43 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  34.92 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  31.44 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  39.22 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  32.28 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  31.09 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  34.68 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  34.2 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  36.49 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  34.65 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  31.66 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  31.68 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.59 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  35.35 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  36.92 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  37.38 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  31.2 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  31.25 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  31.46 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  33.07 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  33.82 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  31 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  34.12 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  32.82 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  33.96 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  36.02 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  30.5 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  31.27 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  32.68 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  30 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  33.08 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  30.92 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  36.02 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  32.71 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  35.32 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  32.55 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  31.84 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  31.95 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  33.98 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  31.95 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  30.04 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  33.94 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  30.04 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32.31 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  30.71 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  33.04 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>