More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0617 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  81.44 
 
 		 264 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  81.82 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  73.86 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  45 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  44.62 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  36.26 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  37.26 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  34.35 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  34.62 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  29.39 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  29.12 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  30.28 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  31.37 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  35.46 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  31.09 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  29.34 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  28.09 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  30.68 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  30.68 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  30.33 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  31.52 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  28.96 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  27.27 
 
 		 284 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  27.48 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  32.35 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  28.46 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  29.22 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  28.02 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  31.37 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  28.02 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  28.02 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.33 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  36.59 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  29.11 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  27.24 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  29.6 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  31.37 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  30.74 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  28.06 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  26.86 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  28.77 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0492  glutamate racemase  36.95 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  31.78 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  30.69 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  32.45 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  28.4 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  28.24 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  31.86 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  27.74 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  27.65 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  27.8 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  31.31 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  28.92 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  23.14 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  33.2 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  27.31 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  27.65 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  30.95 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  30.73 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  25.86 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  28.31 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  26.8 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  34.16 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  29.38 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  28.14 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  26.95 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  30.99 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  28.37 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  31.37 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  26.14 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  32.04 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  26.52 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  28.92 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  27.51 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  26.85 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  28.84 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  28.97 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  28.5 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  34.13 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  28.5 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  29.11 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  26.74 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  26.84 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  26.51 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  28.08 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  27.14 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  27.83 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  26.19 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  25.86 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  28.57 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  25.9 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>