More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  69.08 
 
 		 262 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  67.94 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  51.13 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  45.17 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  45.56 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  38.11 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  36.64 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  43.56 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  45.8 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  34.35 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  41.76 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  43.13 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  40.98 
 
 		 284 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  41.98 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  42.75 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  41.35 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  41.04 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  39.46 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  39.46 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  37.4 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  37.9 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  35.11 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  39.16 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  35.41 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  38.78 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.19 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.08 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  40.99 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  36.5 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  35.88 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  36.33 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  40.67 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  37.4 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.46 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  39.62 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  35.88 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  37.4 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  37.02 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  37.02 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  39.22 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  36.76 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  36.88 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  33.84 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  37.79 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  38.19 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34.13 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34.13 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  34.73 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.58 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  32.02 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.2 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  33.85 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  33.2 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  33.73 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  33.73 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  33.73 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  33.73 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36.36 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  33.33 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  33.33 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  35.97 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  37.65 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  33.33 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  37.65 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36.76 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.08 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  35.97 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  38.32 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  37.3 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  36.11 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  34.46 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  36.9 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  35.51 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  32.54 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  35.74 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  33.49 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.02 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  34.38 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.47 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.33 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  35.5 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  37.85 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  35.55 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  36.21 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  35.1 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  38.74 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  35.89 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  35.92 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  36.22 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  36.5 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  39.92 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  37.8 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  33.07 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  35.51 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  35.5 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  32.32 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  32.32 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  38.25 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>