More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0492 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0492  glutamate racemase  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.49 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  34.4 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  36.95 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  37.25 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  32.86 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  37.2 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0061  glutamate racemase  33.96 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.21676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  35.15 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  33.96 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.82 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  35.07 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  36.45 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  33.03 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  34.48 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  35.27 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  31.22 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  31.22 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  33.18 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  33.18 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  32.35 
 
 		 295 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  35.06 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  33 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  30.84 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33.5 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  31.75 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  33.99 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  33.17 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  31.67 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  32.72 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  29.82 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  37.44 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  33 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  33.33 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.92 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  30.69 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  36.95 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  33.17 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  33.33 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  32.51 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  32.89 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  33.8 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  34.48 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  31.34 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  31.1 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10321  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.62 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22912  normal  0.716928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  32.08 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32.24 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  32.18 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  32.71 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  34.7 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  31.84 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  34.48 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  30.52 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  33 
 
 		 276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  32.29 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18941  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.75 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  29.91 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  32.51 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  31.23 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  30.47 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  30.47 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  32.02 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  33.67 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  32.69 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  29.03 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  30.54 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  32.09 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  30.98 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  33.33 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  32.02 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  29.53 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  32.43 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  31.98 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  32.43 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  29.17 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0153  glutamate racemase  33.66 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000323357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  29.47 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  31.36 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  31.41 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  32.86 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  27.03 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  27.03 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  31.1 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  31.03 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  33.69 
 
 		 300 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  32.45 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  31.36 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  31.4 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  33 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>