225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1906 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 
487 aa  983    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  38.51 
 
 
469 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  34.29 
 
 
465 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  35 
 
 
449 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  34.65 
 
 
459 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  31.43 
 
 
456 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  33.89 
 
 
457 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.73 
 
 
456 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  33.9 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  32.59 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  34.63 
 
 
499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  33.4 
 
 
452 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  31.87 
 
 
454 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  32.22 
 
 
463 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.21 
 
 
462 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  31.48 
 
 
492 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  29.75 
 
 
447 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  29.87 
 
 
459 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  31.97 
 
 
494 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.85 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  31.09 
 
 
493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  31.09 
 
 
493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  28.48 
 
 
464 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.25 
 
 
510 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  32.3 
 
 
463 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  31.01 
 
 
446 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  31.19 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  31.2 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  31.2 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  31.11 
 
 
498 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  31.11 
 
 
498 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 
578 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
494 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 
490 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  30.42 
 
 
494 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  29.18 
 
 
532 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  29.56 
 
 
498 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.88 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  30.46 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
492 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  27.72 
 
 
457 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  28.82 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.68 
 
 
445 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.42 
 
 
444 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.23 
 
 
496 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  25.89 
 
 
565 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.48 
 
 
592 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.79 
 
 
496 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.83 
 
 
479 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.49 
 
 
495 aa  94  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.2 
 
 
625 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.26 
 
 
619 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.79 
 
 
616 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.2 
 
 
624 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.05 
 
 
619 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.9 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  26.07 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  26.64 
 
 
491 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.33 
 
 
478 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.33 
 
 
478 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.24 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  28.99 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  29.84 
 
 
543 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  22.27 
 
 
492 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.42 
 
 
482 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  28.98 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.22 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.16 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  29.55 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.22 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.33 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  26.28 
 
 
466 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.05 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.89 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.94 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  21.94 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  26.25 
 
 
1199 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  22.43 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  24.52 
 
 
520 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.67 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.29 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  25.58 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.59 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.46 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  26.49 
 
 
365 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.11 
 
 
528 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  26.88 
 
 
427 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  24.38 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  22.27 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  26.95 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  21.86 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.11 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  26.59 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.1 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  30.65 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>