125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0382 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 403 aa  834    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  38.28 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  39.01 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  34.47 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  50.57 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  39.38 
 
 		 450 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  38.12 
 
 		 450 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  87.4  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  32.16 
 
 		 1805 aa  86.3  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 201 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  38.35 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  30.39 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  29.69 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  27.72 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  32.65 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  36.76 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  32.02 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  30.52 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  29.33 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  29.56 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.99 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30.14 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  36.04 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  41.41 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  34.72 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  34.53 
 
 		 890 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  32.12 
 
 		 652 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  32.98 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.33 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.14 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.28 
 
 		 907 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  34.38 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  38.89 
 
 		 113 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0367  copper amine oxidase domain protein  38.55 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  32.85 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  37.14 
 
 		 845 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  31.54 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  33.61 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  33.58 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  31.37 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  27.55 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.85 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  27.52 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  27.44 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.82 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  28.93 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  30.72 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  40 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  27.04 
 
 		 948 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  33.88 
 
 		 549 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  27.54 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  31.08 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  35.35 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  26.46 
 
 		 620 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  32.23 
 
 		 535 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1371  copper amine oxidase domain protein  31.54 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000791352  hitchhiker  0.00000351269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  28.32 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  28.14 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  26.55 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  36.73 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 153 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  25.82 
 
 		 574 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  34.21 
 
 		 758 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  32.76 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  30.48 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  25.69 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  28.18 
 
 		 763 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  33.66 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  28.43 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  30.72 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  32.17 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  32.17 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  29.41 
 
 		 763 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  33.66 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  28.57 
 
 		 950 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  28.44 
 
 		 741 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  31.25 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 		 650 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  33.03 
 
 		 749 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.18 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.95 
 
 		 1305 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  31.07 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  24.87 
 
 		 763 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  24.83 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  34.69 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 175 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 143 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>