113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4829 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  100 
 
 		 133 aa  266  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  60 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  60.16 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  54.84 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  58.2 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  55.65 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  52.99 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  53.03 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  51.54 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  49.22 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  49.61 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  50.81 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  53.23 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  52.85 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  51.16 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  50 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  46.97 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  46.4 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  51.67 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  45.9 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  44.53 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  47.66 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  47.66 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  47.66 
 
 		 180 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  47.58 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  49.59 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  41.54 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  43.8 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  48.06 
 
 		 185 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  37.88 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  41.27 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  43.33 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  51.15 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  45.24 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  45.11 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  43.8 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  43.75 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  42.74 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  44.25 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  38.17 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  40.31 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  41.86 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  41.48 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  39.17 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  33.83 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  33.83 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.3 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.1 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.72 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.88 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.3 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.33 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.78 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.07 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.15 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  31.9 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.17 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.34 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  32.87 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  31.72 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  31.72 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.81 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  31.58 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  31.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  31.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  31.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  31.58 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.85 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  33.06 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  37.01 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  30.28 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  32.35 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.59 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.84 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  52.38 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.78 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  36.79 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  34.19 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  35.85 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  35.85 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.45 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  35.85 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.85 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  35.43 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  31.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.81 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  30.58 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  36.79 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  32.81 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.08 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  31.25 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.01 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>