More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2847 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  48.58 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  47.78 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  39.72 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  42.63 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  42.63 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  40.69 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  41.29 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  37.89 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  41.32 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  38.02 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  38.19 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  35.96 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  36.76 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  35.29 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  36.05 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  34.67 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  35.2 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.83 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  35.83 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  34.36 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  38.42 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  38.29 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  38.24 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  32.66 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  31.03 
 
 		 277 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1258  methyltransferase GidB  32.68 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  35.12 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  32.06 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  27.39 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  30.3 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.95 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.41 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  34.97 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  42.11 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  38.36 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  32.68 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  34.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  31.06 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  31.29 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  37.24 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  27.32 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  36.6 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  33.16 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  33.99 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  31.29 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  36.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  35.46 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  29.45 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.75 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  31.1 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  29.41 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  38.76 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  31.82 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  32.86 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.04 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  29.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  25.9 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  32.65 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  34.53 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  25.9 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2055  16S rRNA methyltransferase GidB  35.04 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.460763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  29.38 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  29.25 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>