More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 391 aa  774    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0638  histidine kinase  41.61 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  33.14 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  41.59 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.48 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  36.27 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  35.06 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.19 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.74 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.23 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.41 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  37.06 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 391 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  29.97 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.45 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.29 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.51 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  35.89 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 536 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  36.07 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  32.72 
 
 		 555 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.99 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  34.65 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  29.74 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.84 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.24 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  38.81 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.5 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  35.86 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.26 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.43 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.96 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  33.74 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.56 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.92 
 
 		 597 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  33.33 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.33 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.56 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  34.36 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  36.84 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 451 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  30.1 
 
 		 518 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  25.96 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.85 
 
 		 497 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  33.33 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.33 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 441 aa  92.8  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.42 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.65 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  34.62 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  36.32 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  29.75 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  31.03 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  31.65 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  37.9 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  31.45 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 468 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.95 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  27.73 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  31.39 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  28.04 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.66 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 612 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  30.47 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  34.8 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  28.72 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>