167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0074 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
282 aa  576  1e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  52.88 
 
 
284 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  48.39 
 
 
286 aa  274  1e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.65 
 
 
286 aa  266  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  49.29 
 
 
283 aa  266  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.91 
 
 
282 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
423 aa  63.9  3e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.31867e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 
421 aa  63.9  3e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 
421 aa  63.2  5e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 
408 aa  62  1e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  24.92 
 
 
380 aa  62  1e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  25.32 
 
 
422 aa  62  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.76292e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 
423 aa  60.8  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
419 aa  60.8  2e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  24.05 
 
 
419 aa  61.2  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.75223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  23.66 
 
 
389 aa  60.5  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 
414 aa  59.7  5e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
426 aa  59.7  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
415 aa  59.7  5e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
415 aa  59.3  7e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 
420 aa  59.3  7e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 
423 aa  58.9  1e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  6.11517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
406 aa  57.4  2e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
410 aa  57  3e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  23 
 
 
423 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  25.84 
 
 
433 aa  57  4e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 
418 aa  57  4e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  23 
 
 
423 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
408 aa  56.2  6e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
418 aa  55.8  8e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
414 aa  55.5  9e-07  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
418 aa  55.5  1e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 
421 aa  55.5  1e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.56243e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
408 aa  54.7  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  23.22 
 
 
424 aa  55.1  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.70234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  20.72 
 
 
346 aa  55.5  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  24.39 
 
 
413 aa  55.5  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 
423 aa  55.5  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
409 aa  55.1  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
426 aa  54.3  2e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
417 aa  54.3  2e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
420 aa  54.7  2e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 
413 aa  54.7  2e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  25.16 
 
 
418 aa  54.7  2e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.35965e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
408 aa  54.3  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
420 aa  53.9  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  2.99078e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
420 aa  53.9  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
418 aa  53.9  3e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
426 aa  53.9  3e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 
431 aa  53.9  3e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
420 aa  53.9  3e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
420 aa  53.5  4e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
419 aa  52.4  8e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  unclonable  4.14505e-10 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
418 aa  52.4  9e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 
408 aa  52.4  9e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  21.47 
 
 
377 aa  52.4  9e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  22.63 
 
 
425 aa  52.4  9e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 
426 aa  52  1e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 
421 aa  51.6  1e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 
428 aa  51.6  1e-05  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  28.32 
 
 
401 aa  51.6  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
417 aa  50.8  2e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
417 aa  50.8  2e-05  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
402 aa  50.8  2e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
416 aa  50.8  3e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1206  ATP phosphoribosyltransferase  22.82 
 
 
326 aa  50.4  3e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
430 aa  50.4  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
419 aa  50.4  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  22.73 
 
 
418 aa  50.4  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.27032e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
415 aa  50.4  3e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  23.45 
 
 
441 aa  50.1  4e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
426 aa  50.1  4e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  23.67 
 
 
415 aa  50.4  4e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.75 
 
 
420 aa  50.1  4e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.06 
 
 
420 aa  50.1  4e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.06 
 
 
420 aa  50.1  4e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 
423 aa  49.7  5e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  24.22 
 
 
411 aa  50.1  5e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 
423 aa  49.7  5e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
430 aa  49.7  6e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
408 aa  49.7  6e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 
414 aa  49.3  6e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.75 
 
 
420 aa  49.3  7e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  21.26 
 
 
419 aa  49.3  8e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  23 
 
 
426 aa  49.3  8e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.44 
 
 
420 aa  48.9  8e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.58 
 
 
420 aa  48.9  9e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  23 
 
 
414 aa  48.9  9e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
403 aa  48.9  9e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  24.37 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.58 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  24.82 
 
 
383 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.44 
 
 
420 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>