More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3437 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 358 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  79.61 
 
 		 331 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  48.91 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  48.3 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  42.58 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  44.15 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  43.8 
 
 		 320 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  43.41 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  45.2 
 
 		 312 aa  255  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  44.61 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  44 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  37.64 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  44.24 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  42.03 
 
 		 362 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  45.45 
 
 		 349 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.63 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  36.31 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  39.22 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  38.66 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  33.72 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  34.89 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.83 
 
 		 316 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.72 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.72 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.05 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.56 
 
 		 316 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.56 
 
 		 316 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  48.54 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.44 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.33 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.89 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.77 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.77 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  50.57 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  49.4 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.28 
 
 		 514 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  28.45 
 
 		 304 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.09 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  29.18 
 
 		 265 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  30.75 
 
 		 306 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  43.35 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  27.45 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  36.93 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.16 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  30.58 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  28.13 
 
 		 306 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  28.22 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.17 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.7 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  22.86 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 303 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.03 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  27.42 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.32 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.32 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  27.38 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.84 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  30.41 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  31.58 
 
 		 280 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>