More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3355 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 412 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  83.25 
 
 		 402 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  51.72 
 
 		 383 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.51 
 
 		 369 aa  328  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  51.84 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  48.29 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.78 
 
 		 356 aa  315  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.04 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.04 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.48 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.48 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.48 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  47.77 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  48.51 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.51 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.45 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  43.03 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 366 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  70.99 
 
 		 137 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  49.3 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 218 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 215 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.95 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  60.31 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 209 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  52.67 
 
 		 133 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  48.78 
 
 		 198 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  36.95 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 200 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  43.21 
 
 		 214 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 208 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 200 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  33.69 
 
 		 194 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.16 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.12 
 
 		 200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.12 
 
 		 200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  45.97 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  35.29 
 
 		 200 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 213 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 213 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.21 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  42.11 
 
 		 227 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  48.06 
 
 		 197 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  44.35 
 
 		 168 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  44.35 
 
 		 253 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  44.35 
 
 		 253 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  40.14 
 
 		 211 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  47.37 
 
 		 142 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 201 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  37.01 
 
 		 313 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 226 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.77 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.31 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 212 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  48.03 
 
 		 132 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.61 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 448 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  44 
 
 		 126 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.33 
 
 		 217 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.39 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.85 
 
 		 213 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 		 242 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 230 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.97 
 
 		 205 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 230 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 228 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 202 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 253 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 211 aa  94  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.16 
 
 		 442 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 206 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  37.4 
 
 		 154 aa  92.8  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 224 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 245 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 209 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 203 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 209 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>