220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1403 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  550  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  88.65 
 
 		 282 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  77.57 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  81.66 
 
 		 342 aa  347  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  48.52 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  49.44 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  45.05 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  44.36 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  46.82 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  46.07 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  46.04 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 299 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  44.36 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  45.32 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  47.31 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  42.34 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  46.76 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  45.19 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  43.01 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  44.36 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  44.49 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  48.73 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  46.1 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  46.04 
 
 		 318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  46.82 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  43.59 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  45.35 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  41.34 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  43.45 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  41.64 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  41.64 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  40.96 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  42.05 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  41.54 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  39.71 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  41.91 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  41.26 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.82 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  44.06 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  42.48 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  42.28 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  42.96 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.8 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  40.88 
 
 		 331 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.13 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.69 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  41.31 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  36.33 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  40.74 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  40.57 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  38.97 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  42.23 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  34.35 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  39.38 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.25 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  36.53 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  38.2 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.47 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.41 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.71 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  36.52 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  35.06 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>