More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0337 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  452  1e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  94.27 
 
 
227 aa  399  1e-110  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  81.58 
 
 
229 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  80.09 
 
 
229 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  78.76 
 
 
226 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.09 
 
 
226 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.65 
 
 
226 aa  364  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  79.3 
 
 
228 aa  363  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.85 
 
 
226 aa  362  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.62 
 
 
231 aa  362  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  78.85 
 
 
230 aa  361  5e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  77.97 
 
 
226 aa  359  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.41 
 
 
226 aa  357  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.88 
 
 
226 aa  357  1e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  76.99 
 
 
225 aa  356  2e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  81.5 
 
 
226 aa  355  3e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.97 
 
 
226 aa  355  4e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  75.55 
 
 
229 aa  352  3e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 
228 aa  348  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  73.89 
 
 
227 aa  348  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  74.01 
 
 
228 aa  347  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 
228 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 
228 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  74.89 
 
 
228 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.57 
 
 
226 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.36 
 
 
229 aa  338  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  72.49 
 
 
228 aa  337  9e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  70.93 
 
 
228 aa  332  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  69.47 
 
 
229 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.11 
 
 
226 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.81 
 
 
237 aa  306  2e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  67.7 
 
 
226 aa  302  2e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.05 
 
 
246 aa  292  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 
233 aa  288  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.04 
 
 
231 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  60 
 
 
234 aa  283  1e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.38 
 
 
235 aa  272  2e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 
242 aa  242  4e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 
232 aa  234  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
236 aa  232  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
229 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  50.86 
 
 
235 aa  228  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.56 
 
 
230 aa  221  8e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 
237 aa  220  1e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  49.34 
 
 
235 aa  220  2e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
230 aa  219  2e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 
232 aa  219  2e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 
236 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.32 
 
 
229 aa  219  4e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 
230 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 
233 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  46.67 
 
 
256 aa  216  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 
235 aa  216  3e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
235 aa  216  3e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
230 aa  216  3e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  215  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 
235 aa  215  6e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 
236 aa  215  6e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 
233 aa  214  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.12 
 
 
235 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 
237 aa  214  1e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
250 aa  214  1e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
235 aa  213  1e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 
240 aa  213  1e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.68 
 
 
235 aa  213  1e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  48.5 
 
 
237 aa  213  2e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
239 aa  213  2e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 
321 aa  212  3e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 
230 aa  212  4e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
232 aa  212  5e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  211  5e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  212  5e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  48.46 
 
 
235 aa  211  5e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
238 aa  211  6e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  46.32 
 
 
239 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.54 
 
 
231 aa  211  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 
230 aa  211  8e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 
254 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 
233 aa  210  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
250 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 
231 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
250 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 
257 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
239 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.20928e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  48.5 
 
 
250 aa  208  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
239 aa  209  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.94698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 
246 aa  208  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0723779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>