142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3351 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  100 
 
 
596 aa  1217    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  33.5 
 
 
585 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  33.5 
 
 
585 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  33.5 
 
 
585 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  30.89 
 
 
585 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  30.65 
 
 
585 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  30.77 
 
 
585 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  35.71 
 
 
405 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  38.89 
 
 
262 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  33.47 
 
 
302 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  35.37 
 
 
272 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  36.44 
 
 
261 aa  151  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.56 
 
 
283 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  33.04 
 
 
272 aa  146  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  37.55 
 
 
262 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  35.47 
 
 
263 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  35.48 
 
 
277 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  32.02 
 
 
262 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  32.92 
 
 
272 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  31.88 
 
 
262 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  33.02 
 
 
264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  32.14 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  30.7 
 
 
271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  30.7 
 
 
271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  33.82 
 
 
295 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000482216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  30.14 
 
 
300 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  33.33 
 
 
295 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  33.33 
 
 
295 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  32.02 
 
 
262 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  33.5 
 
 
265 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  30.7 
 
 
271 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  35.18 
 
 
270 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  31.88 
 
 
262 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  31.78 
 
 
858 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  31.28 
 
 
260 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.39 
 
 
617 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  31.7 
 
 
265 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000596311  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  31.7 
 
 
265 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  33.77 
 
 
268 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.8 
 
 
265 aa  124  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  21.99 
 
 
629 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  21.99 
 
 
629 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  32.84 
 
 
272 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  30.73 
 
 
267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.58 
 
 
632 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  31.98 
 
 
282 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 
272 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  31.9 
 
 
271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  34.67 
 
 
264 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000029774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  32.67 
 
 
268 aa  120  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  31.82 
 
 
303 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  30.36 
 
 
562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.75 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  31.55 
 
 
750 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  32.51 
 
 
266 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  23.85 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  31.91 
 
 
288 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.79 
 
 
619 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  32.78 
 
 
274 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  32.98 
 
 
279 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  35.57 
 
 
266 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  35.57 
 
 
266 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  29.29 
 
 
279 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  33.33 
 
 
253 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  25.82 
 
 
306 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  34.54 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.46 
 
 
465 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  31.51 
 
 
248 aa  94  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  28.34 
 
 
275 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  28.34 
 
 
275 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.41 
 
 
747 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  26.48 
 
 
266 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  26.99 
 
 
269 aa  87.8  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  27.4 
 
 
473 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  26.94 
 
 
598 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  27.4 
 
 
269 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  27.4 
 
 
269 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.66 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  31.29 
 
 
671 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  27.92 
 
 
320 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  26.85 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  30.82 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  26.85 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.48 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  28.68 
 
 
728 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  25.51 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.68 
 
 
660 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  31.51 
 
 
590 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  26.48 
 
 
281 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  27.86 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  24.76 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  27.72 
 
 
647 aa  77  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  23.65 
 
 
423 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.05 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  29.71 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  24.77 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  23.81 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  32.81 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  28.14 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  36.45 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>