103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0412 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  41.45 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  42.8 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  41.74 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  40.52 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  40.34 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  38.75 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  39.6 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  40.95 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  39.04 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  40.64 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000029774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  39.31 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  37.11 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  38.28 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  39.44 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  35.04 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  41.82 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  36.19 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  35.04 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000596311  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.04 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  41.36 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  40.77 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  37.46 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  41.36 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000482216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  36.25 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  40.91 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  37.55 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  34.57 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  34.57 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  38.46 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  40.51 
 
 		 266 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  38.66 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  36.91 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  36.32 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  39.57 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  35.29 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  32.09 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  38.83 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  38.35 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  32.56 
 
 		 596 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  34.87 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  31.91 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  34.05 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.78 
 
 		 585 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.78 
 
 		 585 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.78 
 
 		 585 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  32.07 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  27.43 
 
 		 585 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 585 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  25.45 
 
 		 585 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  31.22 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  29.87 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  31.22 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  31.09 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  30.93 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  29.33 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  30.93 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  30.21 
 
 		 473 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  30.93 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  24.56 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  24.56 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  29.69 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  31.77 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  25.1 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  26.21 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  22.98 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  24.41 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  24.52 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  24.52 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 681 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 640 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 636 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 643 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 		 639 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 648 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.11 
 
 		 721 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  31.11 
 
 		 728 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.71 
 
 		 703 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  28.41 
 
 		 681 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 		 640 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 		 645 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 655 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  24.5 
 
 		 586 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  23.86 
 
 		 648 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 		 645 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 648 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.99 
 
 		 628 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  23.86 
 
 		 648 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  27.78 
 
 		 599 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 		 605 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  25.83 
 
 		 597 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 609 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 618 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 		 647 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  27.78 
 
 		 647 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>