223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1071 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  46.96 
 
 		 316 aa  281  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  45.81 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  30.32 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  30.32 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  33.01 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  29.45 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  31.07 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  30.19 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.19 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.19 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.87 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  29.87 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.87 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  29.87 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.19 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  29.87 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  30 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  29.49 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  29.17 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  29.68 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  29.03 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  27.56 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  24.35 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  27.01 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  27.24 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  25.66 
 
 		 700 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  26.32 
 
 		 694 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  25.33 
 
 		 694 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  22.98 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  23.55 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  26 
 
 		 695 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  25.95 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.66 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  20.06 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  23.23 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.45 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.45 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.45 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.45 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.45 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.45 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  24.84 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  22.73 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  22.76 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  22.68 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  25.16 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  25.99 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.57 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  26 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  20.9 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  25.64 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  25.64 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  25.64 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  25.64 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  22.64 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  25.96 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  24.1 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>