72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0854 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  47.83 
 
 
124 aa  102  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  44.58 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  32.14 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  30.91 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  32.38 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.81 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.81 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  31.07 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  31.76 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  27.18 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  29.03 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  29.17 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.26 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  31.68 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.68 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  26.6 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  32.89 
 
 
576 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.3 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  32.04 
 
 
130 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  28.7 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  30.3 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  28.92 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  28.18 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  25.64 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.07 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  35.16 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  34.07 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  27.96 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  31.07 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  25.22 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.02 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  26.32 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.12 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.97 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31.82 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 
134 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  26.25 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  23.02 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  23.58 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  28.28 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.17 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  28.4 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  0.00000582925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  27.16 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  33.67 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  20.69 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  31.25 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  25.25 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  29.31 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  28.3 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  23.85 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  30.19 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  21.9 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  30.39 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  24.42 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  29.76 
 
 
319 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  24.32 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  32.84 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  32.65 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  20.62 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  30.38 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  30.85 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1528  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.467127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>