More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5402 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 408 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  50 
 
 		 409 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 496 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  41.63 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0235  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  45.64 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  44.21 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  43.42 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  44.23 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  43 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.7 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  42.86 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.35 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  42.37 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  41.71 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  42.44 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  40.29 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.69 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  39.52 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  43.56 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.79 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.04 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  39.35 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.83 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  43.59 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.44 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  39.61 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.24 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.58 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  42.27 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.49 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.45 
 
 		 478 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.17 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  37.4 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.91 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.85 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  38.97 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  40 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  38.42 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  39.31 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  39.25 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  39.45 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  40.64 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  36.67 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  37.44 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.16 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  38.99 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.59 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.8 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.48 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.43 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  41.1 
 
 		 555 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0261  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  38.07 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 793 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  40.47 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  37.75 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.07 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 394 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 612 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.33 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.57 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  38.69 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.86 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  37.37 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  35.63 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  38.77 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  39.82 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  37.15 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.96 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.98 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  36.87 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  35.38 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  38.66 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 496 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  35.24 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.1 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>