More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4949 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 147 aa  289  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  55.97 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  47.01 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  53.51 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  50.44 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  47.41 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  47.32 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  57.47 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.14 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  42.61 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.09 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  49.3 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  58.57 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  44.05 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  41.74 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 253 aa  67  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  34.27 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 269 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  30.87 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30.53 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.89 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  30.53 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>