More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  100 
 
 		 362 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.54 
 
 		 508 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.51 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  54.9 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  51.57 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  40 
 
 		 409 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  39.01 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  38.04 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  50.98 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  40.61 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  40.29 
 
 		 433 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  37.46 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  38.16 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 490 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.93 
 
 		 2361 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  36.88 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  52.09 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  35.38 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  34.98 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  32.99 
 
 		 448 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 742 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 407 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 517 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 402 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  39.23 
 
 		 1031 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  40.69 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  36.04 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  34.01 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 574 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  34 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 564 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  35.68 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  33.99 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.97 
 
 		 325 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 438 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 770 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  37.32 
 
 		 1048 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 658 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  37.5 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.72 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 595 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  40.72 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  38.91 
 
 		 662 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  42.49 
 
 		 717 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 682 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 700 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 581 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.85 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  32.4 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 596 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  34.02 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  33.83 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.8 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 775 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  37.06 
 
 		 772 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  33.81 
 
 		 620 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  33.94 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  34.62 
 
 		 1033 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.07 
 
 		 640 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.43 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  37.07 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  32.37 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 594 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 775 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 771 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 682 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 748 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 1229 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>