74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3102 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  100 
 
 		 418 aa  837    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  69.73 
 
 		 418 aa  534  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  69.23 
 
 		 420 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  63.68 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  62.07 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  62.07 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  61.82 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  57.87 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  58.71 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  56.16 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  57.25 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  56.51 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  51.93 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  52.17 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  47.44 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.52 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  43.2 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  33.57 
 
 		 422 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  37 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  34.68 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  32.45 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  31.34 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.79 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.63 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  27 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.38 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.38 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  24.44 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  24.72 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  23.49 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  21.89 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  28.44 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.76 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  27.62 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  26.79 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.05 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  25.77 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  25.77 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  25.77 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  25.77 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  25.77 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.48 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  22.98 
 
 		 957 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  30.48 
 
 		 917 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  25.21 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  25.21 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  25.21 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  24.65 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  24.65 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  25.21 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>