43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0846 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  96.67 
 
 		 420 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  100 
 
 		 420 aa  843    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  72.41 
 
 		 426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  71.95 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  67.06 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  66.83 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  69.25 
 
 		 421 aa  541  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  59.08 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  59.08 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  58.82 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  60.95 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  61.5 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  58.64 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  58.64 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  58.64 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  58.64 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  58.64 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  58.39 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  58.39 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  58.71 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  49.87 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.77 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  45.08 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  42.3 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  38.44 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  34.45 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  35.78 
 
 		 448 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  32.44 
 
 		 445 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 189 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.46 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.46 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>