65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2083 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  100 
 
 		 419 aa  837    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  54.4 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  45.43 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  45.69 
 
 		 426 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  43.11 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  42.86 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  45.06 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.64 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.62 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  43.62 
 
 		 417 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  44.64 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  44.64 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  43.54 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  40.64 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  42.71 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  39.13 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  41.41 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  41.41 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  41.15 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  43.2 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  40.27 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  39.12 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  38.46 
 
 		 437 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  26.47 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  26.47 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  26.78 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.58 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  26.78 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  26.78 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  25.7 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  26.65 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  25.66 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  25.37 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  26.59 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  23.88 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  26.63 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  25.47 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0068  alpha-ketoglutarate permease symporter  31.63 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  25.98 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  22.61 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  25.9 
 
 		 183 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0056  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  22.7 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>