44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4076 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  100 
 
 
421 aa  848    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  76.28 
 
 
430 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  77.62 
 
 
426 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  76.04 
 
 
425 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  77.04 
 
 
426 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  69.05 
 
 
420 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  69.25 
 
 
420 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  60.88 
 
 
435 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  60.88 
 
 
435 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  60.62 
 
 
435 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  57.87 
 
 
418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  57.87 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  59.21 
 
 
417 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  56.79 
 
 
418 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  47.06 
 
 
437 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.31 
 
 
410 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  46.02 
 
 
419 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  44.53 
 
 
427 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  36.36 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  36.7 
 
 
422 aa  269  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  33.85 
 
 
415 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  29.98 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.14 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.53 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  24.5 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  32.05 
 
 
189 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  25.25 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.18 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  20.98 
 
 
397 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  21.04 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.42 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.42 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  22.52 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.38 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  27.78 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  27.21 
 
 
480 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  35.9 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>