More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1544 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  100 
 
 
189 aa  370  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  61.45 
 
 
394 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  50.29 
 
 
389 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  50.29 
 
 
389 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  49.71 
 
 
389 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 
395 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  41.11 
 
 
387 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  42.53 
 
 
389 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  42.53 
 
 
389 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  38.1 
 
 
403 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  45.35 
 
 
405 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  37.57 
 
 
403 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  37.57 
 
 
403 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  39.15 
 
 
403 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  38.17 
 
 
411 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  38.1 
 
 
403 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  37.97 
 
 
403 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  37.97 
 
 
411 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  37.97 
 
 
403 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  41.1 
 
 
414 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  37.97 
 
 
403 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  49.72 
 
 
398 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
398 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  35.98 
 
 
403 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  39.46 
 
 
407 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  36.17 
 
 
403 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 
382 aa  112  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  36.9 
 
 
402 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  36.36 
 
 
403 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  37.82 
 
 
423 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
397 aa  111  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  34.47 
 
 
426 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  50.3 
 
 
403 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
404 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  49.38 
 
 
399 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  36 
 
 
905 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  38.17 
 
 
406 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  38.17 
 
 
406 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  45.27 
 
 
390 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  38.17 
 
 
406 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
397 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  37.71 
 
 
404 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  41.97 
 
 
401 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  38.46 
 
 
404 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 
444 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  38.2 
 
 
467 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  38.2 
 
 
467 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  38.2 
 
 
467 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  38.2 
 
 
467 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  38.6 
 
 
418 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 
398 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.55 
 
 
895 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  49.69 
 
 
412 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  36.84 
 
 
403 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.95 
 
 
441 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  38.55 
 
 
406 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  33.01 
 
 
912 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  44.3 
 
 
395 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  35.67 
 
 
416 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  35.26 
 
 
424 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  37.23 
 
 
417 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
419 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
406 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
419 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  34.83 
 
 
439 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  36.07 
 
 
455 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  35.1 
 
 
472 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  36.65 
 
 
418 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
455 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
417 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  35.33 
 
 
418 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  31.77 
 
 
436 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  43.4 
 
 
414 aa  89  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
421 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  36.02 
 
 
433 aa  87.8  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  34.62 
 
 
472 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  39.55 
 
 
606 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
400 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
420 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  38.46 
 
 
1046 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
421 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  33.68 
 
 
465 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
452 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  37.5 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  31.15 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  31.69 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  38.76 
 
 
468 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  35.52 
 
 
893 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  38.76 
 
 
468 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  30.2 
 
 
409 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
435 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.36 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>