More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1722 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  66.34 
 
 
123 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  63.81 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 
123 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  62.63 
 
 
126 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  54.24 
 
 
124 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  58.59 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.6 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  55.86 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  61.05 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  61.62 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  55.37 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  50.96 
 
 
113 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  57.28 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
116 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
117 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  54.37 
 
 
118 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
119 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.56 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  54.35 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  56.98 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
119 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  45.54 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  45.63 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  51.25 
 
 
336 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  53.01 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 
129 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  53.49 
 
 
116 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
125 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
125 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
125 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  44.55 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
120 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.59 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  46.46 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  53.09 
 
 
347 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  43.52 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  51.9 
 
 
95 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  45.1 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  51.25 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  42.73 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  50.62 
 
 
349 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  44.83 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  42.53 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.97 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  39.29 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  42.67 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  54.41 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  47.95 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  48.48 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  50.72 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  30 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.03 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  47.95 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  30 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
317 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.67 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>