145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1224 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  54.35 
 
 		 692 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 645 aa  1282    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  57.63 
 
 		 695 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  56.16 
 
 		 670 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  57.16 
 
 		 680 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  54.97 
 
 		 679 aa  636    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  52.71 
 
 		 666 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.87 
 
 		 659 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.85 
 
 		 672 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  44.8 
 
 		 719 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  46.57 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  48.89 
 
 		 717 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.32 
 
 		 695 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  43.54 
 
 		 792 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  46.55 
 
 		 684 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.56 
 
 		 710 aa  320  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  34.87 
 
 		 1048 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.86 
 
 		 813 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.94 
 
 		 706 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.3 
 
 		 691 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.13 
 
 		 861 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  31.79 
 
 		 706 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.53 
 
 		 732 aa  230  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  31.52 
 
 		 735 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.92 
 
 		 724 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.87 
 
 		 705 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  32.91 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.36 
 
 		 799 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  31.89 
 
 		 726 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  29.77 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  30.08 
 
 		 742 aa  210  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  28.74 
 
 		 759 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.57 
 
 		 767 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.86 
 
 		 734 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.3 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  32 
 
 		 761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.49 
 
 		 703 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.91 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.93 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.73 
 
 		 746 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.9 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  34.66 
 
 		 742 aa  187  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.81 
 
 		 733 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  35.73 
 
 		 759 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  38.66 
 
 		 754 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.76 
 
 		 766 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  38.46 
 
 		 776 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.32 
 
 		 685 aa  180  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 750 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  35.22 
 
 		 829 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  34.77 
 
 		 724 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  34.77 
 
 		 724 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.53 
 
 		 724 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.48 
 
 		 755 aa  177  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  26.05 
 
 		 706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  30.17 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.19 
 
 		 689 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  25.88 
 
 		 706 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.34 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.34 
 
 		 689 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  36.95 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.5 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.28 
 
 		 726 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.61 
 
 		 741 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  28.1 
 
 		 716 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.91 
 
 		 795 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.75 
 
 		 748 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25 
 
 		 691 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.19 
 
 		 788 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.77 
 
 		 786 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  25 
 
 		 689 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  23.83 
 
 		 691 aa  167  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  23.91 
 
 		 691 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  23.5 
 
 		 689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  32.24 
 
 		 874 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.15 
 
 		 689 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.52 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.28 
 
 		 832 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  26 
 
 		 777 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  34.35 
 
 		 902 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  26.78 
 
 		 712 aa  150  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  20.61 
 
 		 755 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  26.76 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  26.22 
 
 		 748 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  27.32 
 
 		 717 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.74 
 
 		 742 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.98 
 
 		 698 aa  138  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  37.1 
 
 		 702 aa  137  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.15 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.27 
 
 		 764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.76 
 
 		 776 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  34.76 
 
 		 778 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.76 
 
 		 777 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  34.76 
 
 		 776 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  34.76 
 
 		 776 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  34.76 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  34.76 
 
 		 776 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  34.33 
 
 		 777 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.09 
 
 		 772 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.25 
 
 		 763 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>