More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0700 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1075    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  62.38 
 
 		 539 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  59.54 
 
 		 534 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  60.19 
 
 		 540 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  61.61 
 
 		 537 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  61.51 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  59.39 
 
 		 532 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  50.68 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  50.78 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  49.08 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  50.98 
 
 		 521 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  49.59 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  48.51 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  48.18 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  46.56 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  47.9 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  52.81 
 
 		 506 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  46.12 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  45.92 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  45.69 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.07 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  42.33 
 
 		 535 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  46.64 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  48.55 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  45.77 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.78 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 		 532 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  46.31 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 		 542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 		 509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  39.03 
 
 		 509 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  44.16 
 
 		 518 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  39.44 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  39.44 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  47.17 
 
 		 513 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 598 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.23 
 
 		 863 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  38.63 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  48.48 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  43.31 
 
 		 545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.77 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  41.58 
 
 		 541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 531 aa  336  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 502 aa  336  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.34 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  39.26 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  39.01 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  38.27 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 530 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  40.98 
 
 		 566 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  38.87 
 
 		 545 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  42.39 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  39.2 
 
 		 533 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  39.2 
 
 		 533 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  42.66 
 
 		 548 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.49 
 
 		 515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 		 528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  38.01 
 
 		 531 aa  330  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  38.54 
 
 		 531 aa  329  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 533 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  39.43 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 		 513 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  38.87 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 		 847 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 867 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.73 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.7 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  39.81 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  39.14 
 
 		 535 aa  326  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  39.15 
 
 		 534 aa  325  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  40.96 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 546 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  38.24 
 
 		 532 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  39.04 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.82 
 
 		 531 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  38.87 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 532 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 		 537 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 534 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  39.54 
 
 		 565 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>