More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3303 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  100 
 
 
418 aa  844    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  77.94 
 
 
427 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  81.58 
 
 
418 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  78.18 
 
 
417 aa  647    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  60.34 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 
419 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 
419 aa  501  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  61.71 
 
 
420 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  61.59 
 
 
420 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  61.17 
 
 
420 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  59.42 
 
 
418 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  60.24 
 
 
419 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  57.21 
 
 
420 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  57.21 
 
 
420 aa  474  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  57.32 
 
 
414 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  57.32 
 
 
414 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  58.87 
 
 
421 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  54.81 
 
 
419 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  51.45 
 
 
421 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  54.92 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  48.91 
 
 
429 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  47.54 
 
 
407 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  53.27 
 
 
422 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  52.14 
 
 
417 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  48.89 
 
 
394 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  45.8 
 
 
424 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47.74 
 
 
422 aa  362  9e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  46.41 
 
 
418 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  47.57 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.47 
 
 
415 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  44.12 
 
 
415 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.83 
 
 
414 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  42.13 
 
 
415 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  39.51 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.64 
 
 
408 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.49 
 
 
404 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  37.19 
 
 
400 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  36.93 
 
 
400 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  39.5 
 
 
403 aa  255  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  38.3 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  40.55 
 
 
403 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  35.54 
 
 
460 aa  245  9e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  37.94 
 
 
402 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  39.55 
 
 
404 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
404 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  39 
 
 
406 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  38.85 
 
 
404 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
405 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  38.38 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33.82 
 
 
406 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
378 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  32.74 
 
 
388 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  33.54 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.02 
 
 
340 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  31.55 
 
 
348 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.43 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.06 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.16 
 
 
346 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.92 
 
 
360 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  28.88 
 
 
370 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  31.51 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
342 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.01 
 
 
343 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30 
 
 
341 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.53 
 
 
341 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.82 
 
 
346 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 
344 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.22 
 
 
342 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.42 
 
 
340 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  31.79 
 
 
343 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.62 
 
 
342 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  28.85 
 
 
341 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 
342 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.76 
 
 
341 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  31.94 
 
 
343 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  31.94 
 
 
343 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  31.94 
 
 
343 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  29.05 
 
 
367 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.23 
 
 
368 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  27.99 
 
 
341 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.5 
 
 
343 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.3 
 
 
341 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  30.54 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.46 
 
 
341 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.27 
 
 
341 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.95 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  31 
 
 
340 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 
343 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.53 
 
 
341 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.16 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  28.13 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  30.52 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  33.96 
 
 
345 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  28.11 
 
 
369 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  35.57 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  26.7 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000647644  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.58 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  28.8 
 
 
372 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.8 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>