92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0280 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  836    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  59.95 
 
 
405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  54.38 
 
 
394 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  53.87 
 
 
394 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  53.38 
 
 
814 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  53.02 
 
 
397 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  52.21 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  51.63 
 
 
422 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  51.21 
 
 
420 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  51.92 
 
 
412 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  48.89 
 
 
783 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  47.85 
 
 
1293 aa  332  9e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  45.98 
 
 
385 aa  332  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  45.68 
 
 
783 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  45.86 
 
 
382 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  35.19 
 
 
443 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  29.02 
 
 
388 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  26.81 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
443 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
350 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
390 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
398 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
397 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  35.02 
 
 
751 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  33.33 
 
 
741 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
416 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  29.31 
 
 
375 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  29.48 
 
 
374 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  29.66 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  29.66 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  30.04 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  35.06 
 
 
754 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.54 
 
 
391 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.93 
 
 
1119 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
394 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  27.13 
 
 
385 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  24.73 
 
 
370 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.02 
 
 
427 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.02 
 
 
427 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
477 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.64 
 
 
319 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
903 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
729 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.7 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.52 
 
 
477 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.7 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
728 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
728 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
705 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
400 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  27.95 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  23.95 
 
 
942 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  29.76 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  28.21 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  27.5 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  25.73 
 
 
726 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.36 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
859 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  29.93 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3173  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6016  hypothetical protein  25.5 
 
 
383 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  30.58 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.3 
 
 
404 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>