53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  52.62 
 
 
711 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  52.52 
 
 
726 aa  789    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  51.42 
 
 
704 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  50.5 
 
 
700 aa  725    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  48.76 
 
 
728 aa  714    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  51.58 
 
 
707 aa  737    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  50.9 
 
 
727 aa  730    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  100 
 
 
693 aa  1442    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  46.79 
 
 
677 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  46.14 
 
 
697 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  45.69 
 
 
703 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  45.69 
 
 
703 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  45.69 
 
 
703 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  43.98 
 
 
672 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  44.71 
 
 
673 aa  585  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  45.92 
 
 
710 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  44.49 
 
 
699 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  46.2 
 
 
710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  45.48 
 
 
710 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  45.33 
 
 
684 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  45.3 
 
 
702 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  45.44 
 
 
727 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  45.48 
 
 
707 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  43.82 
 
 
683 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  42.73 
 
 
703 aa  546  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  44.77 
 
 
701 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  43.73 
 
 
676 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  39.62 
 
 
680 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  38.77 
 
 
682 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  39.97 
 
 
606 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  33.11 
 
 
1255 aa  301  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  33.72 
 
 
656 aa  293  9e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  32.86 
 
 
682 aa  290  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  31.15 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  30.13 
 
 
678 aa  268  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.89 
 
 
655 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  30.31 
 
 
647 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  29.21 
 
 
659 aa  260  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  30.39 
 
 
648 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  29.53 
 
 
679 aa  241  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.86 
 
 
643 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  26 
 
 
674 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.17 
 
 
615 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  27.17 
 
 
661 aa  181  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  26.42 
 
 
571 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.11 
 
 
630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  26.05 
 
 
574 aa  164  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.87 
 
 
641 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  25.04 
 
 
629 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.55 
 
 
649 aa  153  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  25.18 
 
 
648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.61 
 
 
658 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.07 
 
 
647 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>