113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 531 aa  985    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  41.58 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  45.44 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  43.23 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  42.18 
 
 		 491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  46.9 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  40.62 
 
 		 502 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  40.88 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  35.21 
 
 		 487 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  42.72 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  34.97 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  23.6 
 
 		 473 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  31.4 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 		 473 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.31 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.51 
 
 		 473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  23.11 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  33.86 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  23 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 473 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 473 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 473 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.71 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  22.48 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  23.89 
 
 		 474 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  32.02 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  31.42 
 
 		 463 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.1 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  31.29 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  32.03 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  31.62 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.31 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.31 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  32.85 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.34 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.34 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  28.54 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  30.51 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  27.8 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  28.77 
 
 		 471 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  32.92 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  22 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  20.6 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  32.6 
 
 		 475 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  26.52 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  20.95 
 
 		 466 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  30.45 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  32.65 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  30.75 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  27.23 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  30.85 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  30.58 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  18.56 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.41 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  27.24 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  30.5 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  29.47 
 
 		 469 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  29.04 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.13 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 488 aa  67  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  28.46 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  28.06 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.92 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  25.1 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  26.91 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  31.62 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  28.06 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.94 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  24.28 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  25.34 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  34.27 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  29.56 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  22.22 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  42.47 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  40.26 
 
 		 560 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  37.66 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  37.66 
 
 		 559 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  42.47 
 
 		 560 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  40.26 
 
 		 560 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  39.47 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 		 640 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  37.66 
 
 		 560 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  41.18 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 399 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 397 aa  47.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.28 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>