More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
352 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  73.01 
 
 
361 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  66.57 
 
 
372 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  66.28 
 
 
346 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  66.57 
 
 
348 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  64.83 
 
 
341 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  61.14 
 
 
372 aa  418  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  58.11 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  57.52 
 
 
343 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  55.11 
 
 
352 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  56.72 
 
 
344 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  57.52 
 
 
343 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  56.89 
 
 
343 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  57.23 
 
 
343 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  57.19 
 
 
343 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  56.81 
 
 
345 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  54.05 
 
 
339 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  56.45 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  54.91 
 
 
339 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  54.91 
 
 
343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  49.1 
 
 
349 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  48.06 
 
 
344 aa  281  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  49.85 
 
 
349 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  50 
 
 
350 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  49.41 
 
 
350 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  46.88 
 
 
346 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50.3 
 
 
351 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  47.8 
 
 
359 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  44.18 
 
 
348 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
346 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  47.02 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  46.73 
 
 
346 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  47.34 
 
 
350 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  46.29 
 
 
346 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.07 
 
 
346 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  42.94 
 
 
344 aa  252  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  43.75 
 
 
349 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  43.75 
 
 
349 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  43.75 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  43.23 
 
 
345 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  46.71 
 
 
342 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  47.25 
 
 
346 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.32 
 
 
361 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  42.86 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  44.48 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  40.6 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  39.64 
 
 
354 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  42.26 
 
 
349 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  42.26 
 
 
349 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.14 
 
 
336 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  37.22 
 
 
336 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.85 
 
 
333 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
335 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.09 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.97 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.33 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.87 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  31.48 
 
 
327 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.96 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 
327 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.72 
 
 
326 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  29.38 
 
 
357 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  32.05 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.62 
 
 
318 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.34 
 
 
344 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  33.11 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.11 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  31.48 
 
 
318 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.24 
 
 
349 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.57 
 
 
349 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.28 
 
 
340 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.28 
 
 
340 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.28 
 
 
340 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.43 
 
 
333 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.91 
 
 
349 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.32 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  30.23 
 
 
360 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  30.03 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  33.44 
 
 
364 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  33.23 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.16 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.16 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.16 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.26 
 
 
337 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  22.92 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.15 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  41.41 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  32.67 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  40.15 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.76 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.97 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.23 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.6 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  31.66 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  31.66 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  31.66 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  27.46 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  31.86 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>