More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  55.37 
 
 
615 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  54.69 
 
 
315 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  52.76 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  54.49 
 
 
633 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  40.68 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  43.51 
 
 
293 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  35.27 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  34.15 
 
 
306 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
322 aa  116  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
299 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
306 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
323 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  25.51 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  29.45 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  31.87 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  28.86 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  21.22 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  36.23 
 
 
1074 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  39.02 
 
 
997 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
1137 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.67 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.87 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.25 
 
 
754 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
1072 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
671 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.62 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.62 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  36.92 
 
 
954 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  21.85 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  24.9 
 
 
674 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  32.95 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  24.9 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.27 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  27.27 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
358 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  29.96 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
225 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  27.16 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
714 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
669 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  28.63 
 
 
620 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  24.23 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.3 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
476 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 
480 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>