More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3830 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  97.49 
 
 		 239 aa  486  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  97.49 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  85.77 
 
 		 239 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  80 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  80.83 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  80 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  84.69 
 
 		 249 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  60.91 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  63.56 
 
 		 243 aa  291  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  68.11 
 
 		 299 aa  279  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  65.15 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  65.33 
 
 		 329 aa  274  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  70.06 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  63.18 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  54.91 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.8 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  44.9 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  45.41 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  45.11 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  46.89 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  45.7 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  45.25 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  42.62 
 
 		 202 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  59.83 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  54.84 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  42.78 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  42.78 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  55.47 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.11 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  55.12 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.11 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  42.22 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  53.04 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.08 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.11 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.72 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  49.61 
 
 		 305 aa  131  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  51.69 
 
 		 174 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  48.84 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 		 191 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.57 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  53.98 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  56.52 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.6 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  49.14 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  49.14 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  48.28 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  49.14 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  48.28 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  48.28 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  41.24 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  47.24 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  48.8 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 		 146 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  51.79 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.62 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  39.57 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  39.78 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 438 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  46.55 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  52.59 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  49.56 
 
 		 362 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  47.54 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  45.86 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.23 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  38.42 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  45.08 
 
 		 442 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  46.77 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  48.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  37.57 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  49.56 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  50.43 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>