More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1855 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  1.12067e-09 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  96.01 
 
 
276 aa  547  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  2.39826e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  96.01 
 
 
276 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  82.18 
 
 
277 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  77.74 
 
 
276 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.35519e-05  hitchhiker  6.29591e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  77.37 
 
 
276 aa  444  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  77.01 
 
 
276 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  76.64 
 
 
276 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  73.09 
 
 
280 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  62.32 
 
 
278 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  1.0023e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  64.58 
 
 
284 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 
276 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  58.7 
 
 
277 aa  358  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72829e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  61.45 
 
 
275 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  57.84 
 
 
271 aa  335  4e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  57.84 
 
 
275 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  57.2 
 
 
270 aa  318  4e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.63931e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  42.45 
 
 
282 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 
274 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 
274 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  47.49 
 
 
274 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  50.19 
 
 
274 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  45.35 
 
 
274 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 
274 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 
274 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  47.88 
 
 
274 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  44.98 
 
 
271 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  43.49 
 
 
273 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  43.49 
 
 
328 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.49 
 
 
273 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.49 
 
 
372 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.49 
 
 
328 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
270 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 
285 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
297 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  45.19 
 
 
238 aa  201  1e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
267 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
270 aa  184  2e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
265 aa  117  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
264 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
265 aa  111  1e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
264 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
280 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
273 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.59 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
259 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.44 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
264 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.35 
 
 
283 aa  92  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
265 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.44 
 
 
425 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
300 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 
292 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.06 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.74 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.03 
 
 
259 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.2 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  26.45 
 
 
287 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
291 aa  84.7  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
291 aa  84.7  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
291 aa  84.7  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
277 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 
271 aa  84  2e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
260 aa  84.3  2e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
266 aa  84.7  2e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.9 
 
 
396 aa  83.6  3e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 
261 aa  83.6  4e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 
392 aa  83.2  4e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.4 
 
 
260 aa  83.2  4e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.83 
 
 
282 aa  83.2  5e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
290 aa  82.8  5e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
271 aa  81.6  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
279 aa  80.9  2e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.72 
 
 
279 aa  80.5  2e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  26.29 
 
 
263 aa  80.9  2e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  23.48 
 
 
256 aa  81.3  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.41 
 
 
282 aa  81.3  2e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
275 aa  80.1  4e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 
256 aa  80.1  4e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 
256 aa  80.1  4e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
295 aa  79.7  4e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 
263 aa  79.7  5e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.19 
 
 
263 aa  79.3  5e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>