224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0822 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
1705 aa  3519  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  1.60097e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  34.69 
 
 
1639 aa  811  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  70.25 
 
 
1669 aa  2417  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.23 
 
 
1649 aa  958  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.87 
 
 
1649 aa  944  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.57 
 
 
1648 aa  866  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.4 
 
 
1706 aa  2630  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  76.2 
 
 
1705 aa  2737  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.76 
 
 
1648 aa  870  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  99.94 
 
 
1705 aa  3516  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.88 
 
 
1638 aa  766  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.89 
 
 
1474 aa  691  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.99 
 
 
1645 aa  858  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.83 
 
 
1659 aa  948  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.27 
 
 
1648 aa  853  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  39.81 
 
 
1739 aa  1136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  35.6 
 
 
1634 aa  895  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  33.43 
 
 
1638 aa  792  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  33.28 
 
 
1725 aa  813  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.82 
 
 
1638 aa  763  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  73.53 
 
 
1683 aa  2585  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  34.34 
 
 
1265 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  39.07 
 
 
1258 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  35 
 
 
1287 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  34.38 
 
 
1300 aa  489  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
1312 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  34.13 
 
 
1298 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  33.66 
 
 
1298 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  33.6 
 
 
1298 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.22 
 
 
1293 aa  476  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  33.55 
 
 
1298 aa  470  1e-130  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
1199 aa  468  1e-130  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  33.07 
 
 
1300 aa  454  1e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.26 
 
 
1399 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  67.6 
 
 
319 aa  446  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  34.83 
 
 
1109 aa  361  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  29.21 
 
 
1406 aa  344  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.56 
 
 
1099 aa  281  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  28.36 
 
 
1099 aa  252  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  30.56 
 
 
1116 aa  239  5e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.14 
 
 
1312 aa  231  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  29.92 
 
 
1115 aa  230  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  2.04116e-09 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  31.62 
 
 
983 aa  211  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  30.4 
 
 
1006 aa  206  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.51 
 
 
1000 aa  200  2e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  28.85 
 
 
1042 aa  199  4e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  28.49 
 
 
994 aa  189  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  30.07 
 
 
1109 aa  178  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  27.91 
 
 
1045 aa  173  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1292 aa  172  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  26.7 
 
 
1321 aa  171  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  28.53 
 
 
971 aa  171  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
1283 aa  164  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 
1286 aa  150  2e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.41 
 
 
1407 aa  136  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.41 
 
 
1407 aa  136  4e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  25.94 
 
 
1406 aa  135  8e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.32 
 
 
1407 aa  132  7e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  24.31 
 
 
917 aa  129  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.45 
 
 
917 aa  129  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.88 
 
 
915 aa  128  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  24.45 
 
 
917 aa  127  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  24.57 
 
 
917 aa  126  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  24.31 
 
 
917 aa  126  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  24.46 
 
 
917 aa  126  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  24.46 
 
 
917 aa  126  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  24.31 
 
 
917 aa  125  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  23.56 
 
 
917 aa  123  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  26.86 
 
 
1035 aa  122  5e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.04 
 
 
891 aa  120  2e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 
1160 aa  117  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.92 
 
 
962 aa  117  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  24.09 
 
 
1962 aa  112  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.03 
 
 
660 aa  108  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.26 
 
 
1618 aa  108  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  25.32 
 
 
1809 aa  102  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.37 
 
 
1565 aa  100  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
728 aa  99.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.53 
 
 
1776 aa  99.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.97 
 
 
1212 aa  99  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  25.9 
 
 
1570 aa  98.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  24.11 
 
 
2042 aa  97.8  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.01 
 
 
1323 aa  96.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
883 aa  96.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
1092 aa  93.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.57 
 
 
1075 aa  92.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.32 
 
 
860 aa  89.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.51 
 
 
1234 aa  88.6  1e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
860 aa  88.2  1e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.43 
 
 
1124 aa  86.7  4e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  24.87 
 
 
1233 aa  84.7  1e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  23.85 
 
 
1220 aa  83.2  4e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.58142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.39 
 
 
1570 aa  77  3e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.39 
 
 
1570 aa  76.3  4e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.78 
 
 
1215 aa  75.1  1e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
1191 aa  73.2  4e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
1060 aa  72.8  5e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  38.21 
 
 
1239 aa  68.6  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.62 
 
 
1106 aa  68.2  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  38.28 
 
 
1324 aa  68.6  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>