More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  100 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.58 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.09 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.28 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.06 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  33.59 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  36.67 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  36.8 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  35.48 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  32 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.89 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.11 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  40.62 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  36.29 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.62 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  37.27 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.11 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  34.35 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  38.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.66 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.59 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.79 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  33.6 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  35.48 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.98 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40.38 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  40 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  37.6 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  33.59 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  34.96 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.11 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.67 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.31 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  33.33 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  34.13 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>