230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3952 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  100 
 
 		 230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  43.42 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.45 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  35.51 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  33.03 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  36.67 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.98 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  33.64 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  35.05 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.21 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  29.94 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  27.91 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.09 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.41 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  29.45 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  30.93 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  29.76 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  29.09 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.1 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  28.87 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  27.59 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  26.19 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  30.88 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.65 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  27.55 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 147 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  23.84 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  25.97 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  29.1 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  23.98 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  32.21 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  28.79 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  25.49 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  28.79 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 398 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.56 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  27.66 
 
 		 613 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0988  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.33 
 
 		 485 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00325513  hitchhiker  0.000530591 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.63 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.34 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 620 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1747  signal transduction protein  28.03 
 
 		 126 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 620 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 620 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 615 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 385 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  32.86 
 
 		 384 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  35.34 
 
 		 381 aa  53.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.38 
 
 		 153 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2497  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 485 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0704163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  25.37 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  29.69 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.08 
 
 		 615 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  30.08 
 
 		 615 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.72 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.46 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 384 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.45 
 
 		 491 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  32.28 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.27 
 
 		 426 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  28.43 
 
 		 689 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 384 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 615 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.1 
 
 		 486 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 		 379 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  34.48 
 
 		 463 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.27 
 
 		 485 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.37 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  27.64 
 
 		 503 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.99 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  29.05 
 
 		 153 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  24.43 
 
 		 513 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.72 
 
 		 487 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.72 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.67 
 
 		 485 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 615 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>