More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2331 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  48.65 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  43.58 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  39.03 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  38.06 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  42.53 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  40.55 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  42.4 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 260 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  41.73 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  40.31 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.47 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  40.68 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  44.14 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  39.22 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  39.84 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  41.18 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  39.84 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  39.39 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  39.46 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  40.84 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  40.87 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  37.45 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  39.16 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  38.52 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  39.84 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  38.85 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  40.62 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  40.82 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  39.45 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.84 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  39.84 
 
 		 258 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  40.48 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  38.11 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  38.43 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  40.54 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  38.43 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  37.84 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  39.37 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  39.37 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  36.92 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  36.96 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  38.95 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  39.61 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.1 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.76 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  37.98 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  37.45 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  37.69 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  38.58 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.11 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  38.89 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  37.22 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  36.78 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  37.98 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.37 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  38.58 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  38.66 
 
 		 237 aa  175  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>