More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0559 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
523 aa  1072    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  39.93 
 
 
546 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.35 
 
 
513 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
515 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  28.91 
 
 
518 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  30.59 
 
 
518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  34.2 
 
 
431 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  34.5 
 
 
441 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  32.21 
 
 
591 aa  167  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  39.34 
 
 
911 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
696 aa  163  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
860 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  36.65 
 
 
859 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 
861 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  26.31 
 
 
546 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
864 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.94 
 
 
611 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  36.49 
 
 
735 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 
858 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  38.18 
 
 
746 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.44 
 
 
636 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.29 
 
 
903 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  38.21 
 
 
670 aa  148  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  39.62 
 
 
607 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  39 
 
 
734 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.55 
 
 
737 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.03 
 
 
696 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.1 
 
 
614 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  34.7 
 
 
701 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.18 
 
 
744 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  40.11 
 
 
758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.43 
 
 
971 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
665 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
667 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  40.11 
 
 
758 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  28.26 
 
 
528 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  39.56 
 
 
1093 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.06 
 
 
656 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
758 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.45 
 
 
701 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.8 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.45 
 
 
757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.82 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  36.62 
 
 
638 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  28.97 
 
 
1805 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
752 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.75 
 
 
815 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
1153 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  33.49 
 
 
701 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.45 
 
 
650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.92 
 
 
648 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
969 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.29 
 
 
656 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
794 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 
1207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.1 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.09 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  38.59 
 
 
1160 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.89 
 
 
1020 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  38.05 
 
 
981 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 
643 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.32 
 
 
723 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
764 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 
641 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 
741 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.78 
 
 
577 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.19 
 
 
658 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.97 
 
 
879 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
536 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
483 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
717 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 
744 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.94 
 
 
936 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
593 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.59 
 
 
753 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.7 
 
 
723 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  38.5 
 
 
740 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  33.01 
 
 
822 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.7 
 
 
760 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
702 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
738 aa  120  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.17 
 
 
758 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.59 
 
 
701 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 
479 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.47 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
284 aa  119  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  34.06 
 
 
729 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
1138 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 
380 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.44 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.48 
 
 
754 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.21 
 
 
1134 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.51 
 
 
1081 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.44 
 
 
725 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
643 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
469 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.7 
 
 
483 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>