159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0453 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  31.53 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.11 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.3 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  30.17 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  33.33 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  30.14 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.63 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.57 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.34 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.42 
 
 
423 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  40.66 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  40.66 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  39.56 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  26.11 
 
 
402 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  26.51 
 
 
410 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  23.28 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  21.54 
 
 
405 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  22.88 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.54 
 
 
408 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  22.88 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  26.05 
 
 
409 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  33.33 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  26.07 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  28.81 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  26.15 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  25.52 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
477 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  35.87 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  26.07 
 
 
647 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  25.21 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  23.69 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  24.27 
 
 
397 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  32.06 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25 
 
 
415 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  27.91 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  33.88 
 
 
262 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  30.97 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  26.48 
 
 
406 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  34.21 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  28.24 
 
 
409 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  23.79 
 
 
410 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  26.76 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  35.09 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  32.73 
 
 
667 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  30.95 
 
 
650 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  35.09 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  35.09 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  28.3 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  30.7 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  26.75 
 
 
407 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  28.3 
 
 
284 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  28.3 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  33.64 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  34.19 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  33.9 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  28.3 
 
 
284 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  28.3 
 
 
284 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  28.3 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  34.45 
 
 
330 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.75 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.26 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.75 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.75 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.75 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  23.39 
 
 
410 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  33.06 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  25 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  25.79 
 
 
406 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  32.91 
 
 
668 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  27.03 
 
 
405 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  39.77 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.69 
 
 
311 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  27.47 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  32.11 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  24.88 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  30 
 
 
667 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  24.88 
 
 
205 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28.3 
 
 
284 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
374 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  28.86 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  36.11 
 
 
673 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  28.89 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
303 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>