188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3987 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 477 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  70.65 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  62.22 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  63.3 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  60.5 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  62.04 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  60.74 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  58.93 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  53.88 
 
 		 885 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  53.88 
 
 		 885 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  51.5 
 
 		 884 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2018  phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 		 406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00136436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1399  hypothetical protein  70.94 
 
 		 209 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  57.21 
 
 		 225 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  57.28 
 
 		 231 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  56.81 
 
 		 231 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0624  hypothetical protein  61.43 
 
 		 225 aa  210  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0964  dienelactone hydrolase  60.98 
 
 		 209 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0938  hypothetical protein  60.48 
 
 		 225 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0762  hypothetical protein  60.48 
 
 		 225 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0774  hypothetical protein  60.48 
 
 		 225 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2185  dienelactone hydrolase  59.43 
 
 		 235 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2085  hypothetical protein  57.14 
 
 		 213 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0395  dienelactone hydrolase  58.25 
 
 		 215 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1742  dienelactone hydrolase  57.14 
 
 		 213 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716118  normal  0.0129472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3321  dienelactone hydrolase  59.05 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 		 214 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 219 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1163  hypothetical protein  57.21 
 
 		 221 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1584  hypothetical protein  57.28 
 
 		 216 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.80078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4081  dienelactone hydrolase  55.5 
 
 		 222 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0764  hypothetical protein  51.67 
 
 		 219 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00694911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1414  dienelactone hydrolase  61.34 
 
 		 215 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0690  dienelactone hydrolase  50.24 
 
 		 219 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7040  dienelactone hydrolase  58.29 
 
 		 217 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  50.99 
 
 		 235 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2323  dienelactone hydrolase  58.1 
 
 		 224 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.22 
 
 		 232 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  37 
 
 		 430 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0689  dienelactone hydrolase  60.4 
 
 		 240 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0959  hypothetical protein  55.71 
 
 		 220 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.317094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_670  hypothetical protein  50.24 
 
 		 223 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 224 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  50.47 
 
 		 220 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  46.19 
 
 		 218 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  46.19 
 
 		 218 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 208 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  50 
 
 		 682 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3309  hypothetical protein  64.37 
 
 		 226 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  52.63 
 
 		 221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15340  dienelactone hydrolase-like enzyme  58.02 
 
 		 213 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.678933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  42.58 
 
 		 217 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3680  hypothetical protein  55.34 
 
 		 215 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25730  hypothetical protein  55.77 
 
 		 210 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.725182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 		 232 aa  183  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 		 222 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4552  hypothetical protein  54.17 
 
 		 227 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.399555  normal  0.0205621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4419  hypothetical protein  54.17 
 
 		 227 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1190  dienelactone hydrolase  58.17 
 
 		 219 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  52.4 
 
 		 235 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 220 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  52.4 
 
 		 235 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  52.4 
 
 		 235 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  51.49 
 
 		 222 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  48.36 
 
 		 228 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 229 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1689  hypothetical protein  59.24 
 
 		 217 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0439  dienelactone hydrolase  56.67 
 
 		 215 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  52.75 
 
 		 668 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 230 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  51.42 
 
 		 669 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 		 230 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 		 229 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0853  dienelactone hydrolase  52.11 
 
 		 216 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 210 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1793  dienelactone hydrolase  55.71 
 
 		 214 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  48.54 
 
 		 220 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2656  dienelactone hydrolase  57.14 
 
 		 229 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  50 
 
 		 224 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 223 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0482  dienelactone hydrolase  58.02 
 
 		 220 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 		 223 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 241 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 		 220 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  43.97 
 
 		 845 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  46.79 
 
 		 679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  46.79 
 
 		 679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0527  dienelactone hydrolase  56.19 
 
 		 215 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 		 225 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  50 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  42.93 
 
 		 216 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3232  hypothetical protein  57.36 
 
 		 223 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228343  normal  0.619745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 		 225 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 		 221 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  42.93 
 
 		 216 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 210 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>