More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0112 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
262 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
261 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
267 aa  234  8e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
261 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
261 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
262 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
259 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
260 aa  209  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
263 aa  208  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
262 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
262 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
260 aa  201  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
248 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
261 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
261 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
271 aa  188  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
263 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
260 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.285403  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
247 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
261 aa  181  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
278 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
237 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
259 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
259 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
262 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
277 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
261 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  37.93 
 
 
263 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
262 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
259 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
259 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
260 aa  171  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
261 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
255 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.72 
 
 
249 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
259 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
262 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
259 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736401  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
264 aa  169  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16730  glucose/ribitol dehydrogenase family protein  37.97 
 
 
262 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
259 aa  168  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
269 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
253 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.93 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
259 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
264 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
259 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.43 
 
 
248 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
261 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
259 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0406347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
258 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
260 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.35981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.21 
 
 
260 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03629  oxidoreductase  34.62 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.11 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
259 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
261 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
259 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.5 
 
 
269 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283398  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
261 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
262 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
263 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
246 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
260 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
259 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
259 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
265 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
247 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
248 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
260 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
261 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.274604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
252 aa  158  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
260 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
259 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
259 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>