More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0101 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  100 
 
 		 435 aa  874    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.6 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32 
 
 		 431 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  32.16 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  32.64 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.84 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  32.06 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.99 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.18 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  33.26 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.75 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.53 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.25 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.78 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  31.94 
 
 		 432 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.03 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.58 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  32.03 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.03 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  30.83 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  31.7 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  30.82 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.77 
 
 		 437 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.11 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  32.19 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  31.51 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  31.24 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.25 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  31.24 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.51 
 
 		 434 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.83 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.15 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.65 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.25 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.25 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.08 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.21 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.73 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.76 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.73 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.73 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.97 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.47 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.56 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.39 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.74 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  30.99 
 
 		 434 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.28 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.3 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.44 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.78 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  29.32 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.78 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  30.92 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.55 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  30.64 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.46 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.92 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.54 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  27.42 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  33.17 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.92 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.19 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.69 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  31.43 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.97 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.27 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  28.75 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.12 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  29.17 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.89 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.89 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.67 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.96 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  26.75 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.56 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.55 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.7 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.03 
 
 		 436 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  27.34 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  28.91 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  30 
 
 		 436 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  30.25 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.14 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.98 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  28.97 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  30.77 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.34 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  28.91 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  28.4 
 
 		 518 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  29.61 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  27.94 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  29.87 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>